Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERVK_113P63132 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms