Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CASP2P42575 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CASP2P42575 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CASP2P42575 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms