Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPOP42166 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPOP42166 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPOP42166 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPOP42166 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms