Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK11BP21127 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms