Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PDE6GP18545 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
PDE6GP18545 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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