Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FARP2O94887 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FARP2O94887 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FARP2O94887 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FARP2O94887 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FARP2O94887 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FARP2O94887 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FARP2O94887 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FARP2O94887 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FARP2O94887 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FARP2O94887 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FARP2O94887 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FARP2O94887 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FARP2O94887 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FARP2O94887 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms