Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLOCKO15516 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms