Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CFAP73A6NFT4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CFAP73A6NFT4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms