Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PCYT1BQ9Y5K3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCYT1BQ9Y5K3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCYT1BQ9Y5K3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCYT1BQ9Y5K3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCYT1BQ9Y5K3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCYT1BQ9Y5K3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCYT1BQ9Y5K3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms