Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIT1Q9Y3P8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIT1Q9Y3P8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIT1Q9Y3P8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms