Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTNND2Q9UQB3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTNND2Q9UQB3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTNND2Q9UQB3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTNND2Q9UQB3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms