Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TRAK1Q9UPV9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TRAK1Q9UPV9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
TRAK1Q9UPV9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
TRAK1Q9UPV9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms