Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNRC6BQ9UPQ9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNRC6BQ9UPQ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNRC6BQ9UPQ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms