Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SLC24A2Q9UI40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC24A2Q9UI40 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC24A2Q9UI40 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms