Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZIM2Q9NZV7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZIM2Q9NZV7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM2Q9NZV7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM2Q9NZV7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM2Q9NZV7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM2Q9NZV7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM2Q9NZV7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZIM2Q9NZV7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms