Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LMCD1Q9NZU5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LMCD1Q9NZU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMCD1Q9NZU5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMCD1Q9NZU5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms