Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRP1BQ9NZR2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1BQ9NZR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1BQ9NZR2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms