Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf109Q9NX04 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf109Q9NX04 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C1orf109Q9NX04 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf109Q9NX04 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf109Q9NX04 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf109Q9NX04 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms