Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TOPORSQ9NS56 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TOPORSQ9NS56 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TOPORSQ9NS56 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOPORSQ9NS56 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms