Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDHAF3Q9NRP4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SDHAF3Q9NRP4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SDHAF3Q9NRP4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms