Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INCENPQ9NQS7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
INCENPQ9NQS7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
INCENPQ9NQS7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
INCENPQ9NQS7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
INCENPQ9NQS7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms