Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L4AQ9HCS5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPB41L4AQ9HCS5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms