Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC24A3Q9HC58 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC24A3Q9HC58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC24A3Q9HC58 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms