Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMURF2Q9HAU4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SMURF2Q9HAU4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms