Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C5orf42Q9H799 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C5orf42Q9H799 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C5orf42Q9H799 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms