Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C11orf49Q9H6J7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
C11orf49Q9H6J7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C11orf49Q9H6J7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C11orf49Q9H6J7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms