Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIF1Q9H611 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIF1Q9H611 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PIF1Q9H611 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms