Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRDM12Q9H4Q4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PRDM12Q9H4Q4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRDM12Q9H4Q4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms