Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B7

TUBB1, Tubulin beta-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB1Q9H4B7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB1Q9H4B7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBB1Q9H4B7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB1Q9H4B7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms