Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRN3Q9H3W5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN3Q9H3W5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms