Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXQ1Q9C009 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXQ1Q9C009 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXQ1Q9C009 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXQ1Q9C009 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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