Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SCAPERQ9BY12 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SCAPERQ9BY12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SCAPERQ9BY12 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
SCAPERQ9BY12 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SCAPERQ9BY12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms