Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PLVAPQ9BX97 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PLVAPQ9BX97 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PLVAPQ9BX97 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PLVAPQ9BX97 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms