Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV3

CDADC1, Cytidine and dCMP deaminase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDADC1Q9BWV3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDADC1Q9BWV3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDADC1Q9BWV3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDADC1Q9BWV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDADC1Q9BWV3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDADC1Q9BWV3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDADC1Q9BWV3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDADC1Q9BWV3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDADC1Q9BWV3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDADC1Q9BWV3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDADC1Q9BWV3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDADC1Q9BWV3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms