Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 DEDD2-211ENST00000601135 723 ntTSL 221.03■□□□□ 0.964e-12■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 EPS8L3-205ENST00000475725 468 ntTSL 215.19■□□□□ 0.029e-11■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.054e-8■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 KRBA1-209ENST00000621069 3449 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 KRBA1-203ENST00000485033 3434 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 KRBA1-207ENST00000496259 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.54e-8■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 EGFR-211ENST00000638463 4735 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 TLK2-216ENST00000583690 496 ntTSL 511.52□□□□□ -0.574e-12■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 LPIN3-204ENST00000496565 568 ntTSL 39.92□□□□□ -0.824e-12■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 EPS8-208ENST00000541465 581 ntTSL 26.81□□□□□ -1.324e-6■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.687e-8■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.347e-8■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.127e-8■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.017e-8■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 VAMP2-203ENST00000481878 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.097e-8■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.927e-8■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.547e-8■■■■■ 31.4
BUD13Q9BRD0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.755e-12■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC14.29□□□□□ -0.123e-8■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 PRPF31-205ENST00000445811 928 ntTSL 521.58■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 PRPF31-204ENST00000445124 886 ntTSL 518.84■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 PRPF31-206ENST00000447810 854 ntTSL 518.84■□□□□ 0.613e-7■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 NOL6-205ENST00000464829 1829 ntTSL 217.02■□□□□ 0.318e-7■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 NOL6-201ENST00000297990 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.25□□□□□ -0.298e-7■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 NOL6-202ENST00000353159 3411 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.698e-7■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 31.3
BUD13Q9BRD0 RECQL4-206ENST00000534270 517 ntTSL 325.1■■□□□ 1.612e-20■■■■■ 31.2
BUD13Q9BRD0 PKM-224ENST00000569857 1355 ntTSL 513.78□□□□□ -0.28e-16■■■■■ 31.2
BUD13Q9BRD0 KPNA5-203ENST00000413340 689 ntTSL 320.96■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 31.2
BUD13Q9BRD0 ZZEF1-207ENST00000573183 2667 ntTSL 213.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 31.2
BUD13Q9BRD0 ZZEF1-203ENST00000571436 2831 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 31.2
BUD13Q9BRD0 KPNA5-201ENST00000356348 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 31.2
BUD13Q9BRD0 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -22e-6■■■■■ 31.2
BUD13Q9BRD0 TMC6-213ENST00000589933 580 ntTSL 324.7■■□□□ 1.542e-11■■■■■ 31.2
BUD13Q9BRD0 NR6A1-204ENST00000475178 742 ntTSL 38.08□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 GPT-207ENST00000534702 1300 ntTSL 526.88■■□□□ 1.895e-6■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 GPT-203ENST00000527165 1865 ntTSL 222.24■■□□□ 1.155e-6■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 GPT-201ENST00000354769 583 ntTSL 219.71■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 GPT-204ENST00000527961 549 ntTSL 519.2■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 LIMK2-207ENST00000465937 951 ntTSL 315.14■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 31.1
BUD13Q9BRD0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.353e-31■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.283e-31■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.243e-31■■■■■ 31
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BUD13Q9BRD0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.669e-7■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.19e-7■■■■■ 31
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BUD13Q9BRD0 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.024e-8■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 ANKRD16-204ENST00000492368 741 ntTSL 28.47□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.253e-11■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC3.08□□□□□ -1.922e-17■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 SNAPC4-202ENST00000637388 1398 ntTSL 517.76■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 TNS1-210ENST00000446903 2464 ntTSL 1 (best)14.81□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 31
BUD13Q9BRD0 PCK1-205ENST00000485958 581 ntTSL 27.31□□□□□ -1.241e-9■■■■■ 30.9
BUD13Q9BRD0 RNF207-206ENST00000485539 1413 ntTSL 1 (best)27.62■■■□□ 2.019e-7■■■■■ 30.9
BUD13Q9BRD0 RNF207-209ENST00000496676 3020 ntTSL 213.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 30.9
BUD13Q9BRD0 RPL6-212ENST00000553205 899 ntTSL 27.89□□□□□ -1.151e-12■■■■■ 30.8
BUD13Q9BRD0 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 30.8
BUD13Q9BRD0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 30.8
BUD13Q9BRD0 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 30.8
BUD13Q9BRD0 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 30.8
BUD13Q9BRD0 PLEKHA2-209ENST00000617275 5582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 30.8
BUD13Q9BRD0 IDUA-206ENST00000508168 520 ntTSL 327.53■■■□□ 22e-10■■■■■ 30.8
BUD13Q9BRD0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.241e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.111e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.561e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 SS18L1-205ENST00000492466 899 ntTSL 517.12■□□□□ 0.331e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 SS18L1-204ENST00000491916 456 ntTSL 217.11■□□□□ 0.332e-21■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATP6V1E1-208ENST00000481365 692 ntTSL 48.29□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.181e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ATP6V1E1-204ENST00000413576 800 ntTSL 35.71□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-209ENST00000478424 1059 ntTSL 229.12■■■□□ 2.255e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-208ENST00000478336 930 ntTSL 227.01■■□□□ 1.915e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-206ENST00000473949 578 ntTSL 524.36■■□□□ 1.495e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.445e-9■■■■■ 30.7
BUD13Q9BRD0 C8orf33-203ENST00000529593 495 ntTSL 522.65■■□□□ 1.221e-8■■■■■ 30.7
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