Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NOTCH4Q99466 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NOTCH4Q99466 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms