Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIGSQ96S52 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
PIGSQ96S52 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PIGSQ96S52 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIGSQ96S52 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms