Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
IFT140Q96RY7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC40.09■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
IFT140Q96RY7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC40.07■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC40.07■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC40.04■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.02■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
IFT140Q96RY7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC40■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC39.95■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.99
IFT140Q96RY7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
IFT140Q96RY7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
IFT140Q96RY7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
IFT140Q96RY7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
IFT140Q96RY7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
IFT140Q96RY7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
IFT140Q96RY7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
IFT140Q96RY7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
IFT140Q96RY7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
IFT140Q96RY7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
IFT140Q96RY7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms