Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRAMP1Q96RY5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRAMP1Q96RY5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRAMP1Q96RY5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRAMP1Q96RY5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1923.9 ms