Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBGCP5Q96RT8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBGCP5Q96RT8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBGCP5Q96RT8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms