Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF13CQ96RJ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF13CQ96RJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms