Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC9Q96Q05 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC9Q96Q05 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms