Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NLRP3Q96P20 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NLRP3Q96P20 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NLRP3Q96P20 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NLRP3Q96P20 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms