Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF578Q96N58 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF578Q96N58 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF578Q96N58 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms