Protein–RNA interactions for Protein: Q96N35

LINC00052, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00052, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00052Q96N35 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00052Q96N35 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00052Q96N35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms