Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPNQ96H22 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPNQ96H22 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPNQ96H22 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms