Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23CQ96ET8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TVP23CQ96ET8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23CQ96ET8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms