Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC51Q96ER9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC51Q96ER9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC51Q96ER9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC51Q96ER9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms