Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MALSU1Q96EH3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MALSU1Q96EH3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms