Protein–RNA interactions for Protein: Q969E4

TCEAL3, Transcription elongation factor A protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEAL3Q969E4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCEAL3Q969E4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCEAL3Q969E4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCEAL3Q969E4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms